查询北京银行医保存折余额，可以按照以下方式进行：

1. 前往银行柜台查询：携带身份证件和存折前往北京银行任一网点柜台，告知工作人员想要查询医保存折余额，工作人员即可帮忙查询。

2. 在自助查询机查询：在有自助查询机的北京银行网点，可以通过自助查询机查询医保存折余额。将存折插入自助查询机，输入密码后，进入账户管理页面即可查询余额。

3. 网上查询：登录北京银行官网，填写账号、密码和验证码即可查询到个人医保存折余额。或者使用手机银行也可以查询到医保存折余额。

此外，还可以通过电话咨询和微信公众号查询医保存折余额。需要注意的是，由于涉及个人隐私，请确保在官方渠道进行查询，并确保信息安全。建议定期查询医保存折余额以确保其准确性并随时了解个人医保情况。如有更多问题，可咨询北京银行工作人员获取帮助。